Ένα σημαντικό πλεονέκτημα του ΤΕΠΙΧ ΙΙΙ – Ταμείου Εγγυοδοσίας είναι ότι η προμήθεια για την εγγύηση που παρέχει το Ταμείο καλύπτεται πλήρως για όλη τη διάρκεια της χρηματοδότησης.

Αυτό σημαίνει ότι η επιχείρηση δεν επιβαρύνεται με πρόσθετο κόστος για την εγγύηση του Ταμείου. Για τον λόγο αυτό, κατά τη σύγκριση μιας πρότασης χρηματοδότησης μέσω ΤΕΠΙΧ ΙΙΙ με ένα συμβατικό τραπεζικό δάνειο, δεν πρέπει να εξετάζεται μόνο το ονομαστικό επιτόκιο, αλλά το συνολικό κόστος χρηματοδότησης.